星海领航员

NGS从业者,肿瘤早筛、CGT、基因编辑领域探索者。

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      ·03-13 11:36

      测序反应通用试剂:保留了身份,废掉了“功能”

      管松了无法无天,管严了原地暴毙?‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍——监管也挺难昨天行业里有一份重要的文件,相信大家都看过了《二代基因测序相关体外诊断试剂分类界定指导原则(征求意见稿)》其中最引人注目的,是“测序反应通用试剂”在消失近一年后的回归。政策解读有很多朋友做了,比如九哥的这篇,来龙去脉都很清晰300+测序反应通用试剂盒的 I 类身份,又“失而复得”?我们换个角度,揣摩一下这份文件背后的导向。通俗的表示就是:此次回归的监管变化,目的是什么?PS:这篇仅代表个人观点。如果我俩理解不一样,那么你是对的。欢迎留言区探讨。01“初心”文件公布的第一时间,就有不少朋友在喜迎“测序通用反应试剂”的回归。对此,五星评论家麦克阿瑟表示:切忌半场开香槟。“回归”自然不假,但对于“回归”的理解,可能不太一样。我的理解是:指导原则的核心目的,是让测序反应通用试剂回归初心。那,什么是初心?NGS的全流程包括了提取、纯化、建库、测序反应、分析。也就是说:不管监管界定“测序反应试剂”是I类还是III类,它本来就是存在的。要想实现NGS全流程的合规监管,就一定要给其一个“身份”。但既往这个身份拿的过于容易,就滋生出了灰区。就如九哥所言:业内朋友知道,“测序反应通用试剂盒”,并不是一个简单的I类试剂(此前);在很多时候,它还承载了商业合作中的“更多功能”。九哥的小九九,公众号:基因江湖消失的“测序反应通用试剂盒”,347款产品何去何从?既往很多张I类证的备案是出于什么考量,大家都不用揣着明白装糊涂。这在实践中带来的是不公平,对认真报3类证、做临床验证、走合规进院的企业,是不公平的。“凭什么在投入完全不在一个量级的情况下,3类证和1类证有类似的商业价值?”是时候让它更纯粹一点了。顺着这个思
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    • 星海领航员星海领航员
      ·03-13 11:36

      投标万金油“测序反应通用试剂盒”,还能继续玩吗?

             昨天下午国家药监局发布了“二代基因测序相关体外诊断试剂分类界定指导原则”,很多大佬群友都在讨论,出现频率最高的次一个是“终于出来了”,一个是测序界的投标神器“测序反应通用试剂盒”还能不能用?这个事情还要从去年5月11日新的IVD目录里面去掉了测序反应通用试剂盒说起,当时九哥做了解读整理,从那以后这个事情再也没有声音,到今天刚好10个月,“十月怀胎,一朝分娩”,搞注册的的大佬们都是懂时间节点的。      不废话了,常看我的文章的朋友都知道,我完全是不懂注册的,还好各个群里的大神,deespeek也懂,多跑几圈,想知道的答案都有了。  1.为什么会出现这个指导原则?        二代测序技术出现不过十多年,真正大规模应用到临床也不过最近这些年,很多相关试剂的注册处于乱开车状态,如今测序试剂已经广泛使用,作为一类管理,而建库试剂要整体申报三类,不能拆分组分单独申报。 2.为什么大家对这个指导原则如此期待?       5月11日以后前,注册是乱的,混乱也是活力的一种体现,但5月11以后 ,到今天,这10个月备案的很少很少,大家都不知道该如何进行下一步,行业都快停摆了,这个文件终于出来了,喜大普奔。  3.有哪些影响?      (1)对行业的影响,会结束测序行业注册混乱的局面,推荐测序行业积极正面发展      (2)对相关企业的影响,测序企业的注册更加规范化,不再允许出现类似一张“测序反应通用试剂盒”或者“核酸提取试剂盒”证书投800个标,有1000个价格的情况,要求企业去正视注册,规范化注册,在注册方面加大投入,这个行业不景气的时候
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      ·03-09

      我们已经开始厌倦A.I.

      事情的起因是这样的,昨天我们转载了九爷的一篇文章。有朋友批评“AI味”太浓了,我觉得这是一个很好的角度,正好跟大家分享下个人的感受。我们先做个框定,讨论的内容仅限于AI生成类内容,也就是AIGC。帮你写代码、做重复工作的不算,那只能叫牛马辅助器。#01“原始的冲动”人类对于造物似乎是刻在DNA里的技能,甚至包括要创造另一个自己。ChatGPT还没火的时候就接触过了,只不过当时当成了乐子。一群论坛里面没品的人把ChatGPT改造成各种性格的角色,通过对话进行角色扮演。而有些角色,总能让你老脸一红。当时可能没有人意识到,这些“老变态”调教AI的手段就叫“提示词工程”。再到后来,有了Stabe Diffusion之类的文生图工具,这帮货又有了新玩具。那时候,各种风格的NSFW模型被训练出来,他们称之为“炼丹”。当然,以上这只能算暗线。最早适用ChatGPT类工具进行的工作是帮孩子写作业,包括Kimi、豆包、ChatGPT都被用来干这个事。当然,还得小心,这些货总会时不时整出个“3.11>3.9”的幺蛾子来。及至后来,我会用他们去翻译文献、报告等。毕竟全英文的看起来还是很吃力,有翻译过的还是更方便。所以你看,人类原始的冲动:“**(自己补全)”和偷懒是促进AIGC产品发展的动力。人们乐此不疲的使用着这些工具,那又怎么厌倦了呢?#02“缺点”在调教ChatGPT的初级阶段,这些提示词工程师们就发现了AIGC的一些问题。比如,经常会出现忘记上下文的“老年痴呆”,逻辑性缺失等问题。就跟谈恋爱好不容易发展到牵手走进电影院,一出来对方就问你是谁,那感觉....文生图时代,“炼丹”的“废品率”也不低。比如6根手指、不合理的关节角度等等,也是让人眼前一黑。当然,运用到工作上就更是灾难级别了。比如2023年这个案例是非常典型的AIGC应用到工作中的反面案例,律师在查找案例时偷懒,直接让Cha
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      ·02-24

      Guardant Health:超预期的现实与谨慎保守的未来

      环球视野,深度视角本文星球首发,感兴趣的见文末。各位亲爱的股东,大家早上好中午好晚上好。Guardant Health 2024Q4的财报终于发出来了。这份财报将为我们揭开其肠癌早筛产品Shield销售情况的神秘面纱,回答2024Q4及其全年经营状况如何的问题,同时给出2025年财务状况的预估。因此,很重要。我们先说结论:2024Q4及全年营收超出预期,但是2025年预估很谨慎。#01超预期的现实2025年2月20日,Guardant Health发布2024Q4财报。财报显示,本季度营收2.018亿美元,同比增长30%,环比增长5.4%。2024全年营收7.39亿美元,相较于去年增长31%。2024Q4亏损1.11亿美元,同比所见40.7%,但是环比扩大3.0%。我们在分析上个季度的时候做过总结,其全年营收预期约为7.20亿-7.25亿美元。妥妥的超出预期。总样本量约为74750例,同比增长23.7%,环比增长6.2%。肠癌早筛产品Shield卖了约6400例,收入约为410万美元。公司毛利率2024Q4达到63%,如果去除肠癌早筛产品这能达到64%。全年毛利率62%,去除肠癌早筛提升到64%。害,虽说是超预期,这肠癌早筛启动阶段还真是烧钱啊。#02烧出个未来上文中有个细节,2024Q4 Shield卖了6400例,收入410万美元。也就是说大约一个样品能够拿到640美元,已知Medicare给的报销价格是920美元。呃,这是7折入院的意思吧?这货的成本是在600美元左右(还是在2024Q4以后...),也就是说上市后按照950美元报销的话只能算是勉强回本。还不算Guardant这手头养着超过100人规模的商业化团队...这都是要烧钱的。不过没关系,2025年报销就按照1495来算了,多少能有点回头钱。害,美国医保还真是有钱。当然,烧钱也要烧到地方。Shield已经摆出车
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      ·02-24

      Illumina&Broad 50亿细胞图谱计划启动

      环球视野,深度视角本文星球首发,感兴趣的见文末。Illumina最近的防守...很积极。老粉都知道,前段时间UKB-PPP前脚跟Olink+Ultima牵了牵手。后脚,Illumina就还以颜色。无缘60万例样本,测序仪大厂泪奔2025-01-12 Illumina疾速反击2025-01-14 前几天,CZI(Chan Zuckerberg Initiative)跟10x Genomics+Ultima搞了个10亿单细胞计划。CZI给Illumina“上眼药”这不,Illumina没过两天又跳了出来。2025年2月21日,Illumina公司与Broad Clinical Labs达成合作,旨在快速推进单细胞项目,利用尖端工具和工作流程,为单细胞研究设定标准,并在三年内加速开发包含50亿细胞的细胞图谱。好家伙,你10亿,我50亿。优势在我!此次合作将结合Illumina的Illumina Single Cell 3' RNA Prep、NovaSeq X Plus平台、DRAGEN析软件,以及Broad的Perturb-seq、CRISPR筛选等先进技术,助力研究人员以前所未有的速度和准确性处理和分析大量单细胞数据,推动疾病建模和药物开发等领域的发现。Broad Clinical Labs (BCL) 是测序圣地Broad研究所的下设机构,拥有CLIA认证实验室,根正苗红。自2013年以来,已经完成696473例全基因组测序。好玩的是,Illumina本来测序仪的下机文件就是*.bcl,需要通过bcl2fastq才能转换为我们熟悉的fastq文件。虽然,我相信这是巧合。不管怎样,Illumina的意图非常明确。“BCL才是正统,是“老钱”,你CZI算哪颗葱?”不过,这次合作并未说明资金从哪里来。急了,他急了...话说,一味防守似乎也不是个事啊亲。咱就不能
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      ·02-23

      GRAIL:亏损20亿美元,别怕

      环球视野,深度视角本文星球首发,感兴趣的见文末。各位亲爱的股东,大家早上好中午好晚上好。作为多癌早筛的龙头,GRAIL从Illumina分拆后其实没什么大事。毕竟,旗舰产品Galleri 虽说是开卖了,但是没有FDA的PMA(pre-market application),还算不得堂堂正正。但是,财报还要看...毕竟...龙头。#011:202025年2月20日,GRAIL发布了2024Q4和全年的财报。财报显示,2024年度公司售出了13.7万份Galleri多癌早筛检测,营收增长45%达到1.086亿美元。稍微平均下,大约每个季度售出Galleri检测3.4万份左右。当然,GRAIL还有其他收入哈,总营收1.256亿美元,增长35%。不过,亏损上GRAIL看起来更龙头一点。根据财报,2024全年净亏损20.27亿美元...首先,别紧张,看看去年,亏了15亿美元左右...呃..稳住,仔细看,主要是因为商誉损失。害,吓一跳。如果去除这部分,那一年也就亏了6个亿,比去年亏的7.5亿少多了啊,泪目...其实,2024年GRAIL还是干了不少事(包括最近)。#02打基础首先,Galleri检测升级。根据财报电话会议的内容,新版Galleri检测与前代相比减少了Panel的大小,并且加入了自动化流程。据悉,单次测序样本量提升了4倍(也就是说panel缩小到了原来的1/4?)。第二,拓展支付渠道。与TRICARE将Galleri纳入覆盖范围,针对50岁以上高风险人群,TRICARE是美国军方的医保。直白点说,砍谁的预算也不敢砍军队保险预算。不然,那帮子人可是真有枪啊。第三,与Quest合作增加可及性。Quest Diagnostics合作覆盖全美7400个采血点,打广告、吸引新用户都是题中之意。第四,清除法规障碍;国会两党支持推动《MCED法案》,目标将多癌早筛纳入医保报销(对标结直
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      ·02-16

      贺建奎:人类胚胎基因编辑商业计划书

      环球视野,深度视角各位亲爱的股东,大家早上好中午好晚上好。Illumina事件继续精彩,我们继续换换脑子。声明:本文涉及的图片和相关内容均来自公开网络资料,并不代表个人或者本号支持相关行为。2025年初,知名基因编辑研究者贺建奎博士公布了自己一份人类胚胎基因编辑商业计划书。国内好像没看到有人聊,那我们就简单分享下。ps,由于源文件贺建奎博士已经删除,因此原来想给大家分享来着,想想算了,也许会放星球上吧。其实也没太多必要,关键的都在这里了。#01背景贺建奎博士业内知名,圈子外也不遑多让。贺建奎(1984年—),男,湖南省新化县人 ,曾在南方科技大学任副教授,拥有多学科交叉的背景,并在基因测序仪研究, CRISPR基因编辑,生物信息学等多个领域取得研究突破。他的实验室将高通量测序应用到免疫细胞受体库的多样性研究。主要研究实验室用物理,统计和信息学的交叉技术来研究复杂的生物系统。研究集中于免疫组库测序,个体化医疗,生物信息学和系统生物学。贺建奎博士最为知名的是“基因编辑婴儿”事件。2018年11月26日,贺建奎“基因编辑婴儿”事件引发轩然大波 ;12月19日,贺建奎入选《Nature》年度十大科学人物 。2019年1月21日,从广东省“基因编辑婴儿事件”调查组获悉,已初步查明,该事件系贺建奎为追逐个人名利,自筹资金,蓄意逃避监管,私自组织有关人员,实施国家明令禁止的以生殖为目的的人类胚胎基因编辑活动 ;1月21日,南方科技大学研究决定解除与贺建奎的劳动合同关系;2月,贺建奎的一篇研究论文被撤稿 ;12月30日,“基因编辑婴儿”案在深圳市南山区人民法院一审公开宣判,贺建奎被依法判处有期徒刑三年,并处罚金人民币三百万元。2022年4月,据健康时报报道,贺建奎已刑满释放。(以上均来自百度百科)真迈的未来是否会再生波澜?一则朋友圈引起的无限遐想贺建奎博士另外一重身份是瀚海基因(真迈前身)
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      ·02-16

      Bio-Rad收购数字PCR开发商 Stilla Technologies

      Bio-Rad Laboratories近日宣布,已签署一项具有约束力的要约,收购Stilla Technologies的所有股权。 Bio-Rad是生命科学研究和临床诊断产品领域的全球领导者。Bio-Rad在2024 年收入达 26 亿美元,拥有两个高度互补的业务部分生命科学(服务研究和生物制药客户,营收占比40%)和临床诊断(占比60%),各自包含多样的产品组合。 上图仅为示意,显示的是2022年的数据 Bio-Rad生命科学业务的其中一个主要支柱就是液滴数字PCR。过去几年,Bio-Rad通过不断推出新平台及投资组合创新推动了ddPCR的更广泛采用。围绕不同性能的需求,如通量、灵敏度、成本等,推出了QX的不同产品组合,同时也开发了服务不同应用的assay组合。 除此之外,利用RT-PCR和数字PCR进行分子诊断的临床应用也是Bio-Rad临床诊断业务增长的一个重要支柱。 通过推动产品创新、进行投资并建立战略合作伙伴关系,Bio-Rad进一步将自己的ddPCR 平台扩展到生命科学研究和临床诊断领域。如最近投资了Geneoscopy,支持其推出经 FDA 批准的、利用自己的ddPCR 平台的非侵入性结直肠癌筛查测试,投资了Oncocyte,将该公司的移植监测检测商业化,部署到自己的 QX600 ddPCR 系统上,为实验室客户提供比集中测序检测供应商更灵敏的替代方案。 在整体战略上,Bio-Rad采取类似的更有针对性的并购策略来促进增长。例如作为在细胞生物学领域产品开发战略的一部分,Bio-Rad收购了 Saber Bio,这是一个开发阶段平台,利用液滴技术高通量发现新型抗体和 T 细胞受体,这在识别潜在治疗候选药物方面发挥着至关重要的作用。而最近宣布有
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      ·02-15

      PacBio:营收下滑33%还盈利了???

      环球视野,深度视角各位亲爱的股东,大家早上好中午好晚上好。长读长测序除了Nanopore这样的纳米孔测序还有一个实时单分子测序的PacBio硕果仅存...的上市公司。就在2025年2月13日,PacBio发布了2024Q4的财报。今天,就跟大家一起梳理下这家公司Q4的表现和大家关心(其实是我关心)的一些问题。2个核心问题:干的怎么样?未来有没有前途?#01其实也不意外2024Q4,PacBio营收3920万美元,同比大幅下降33%。但是其实...大家并不意外,毕竟上个季度下滑28.2%,也没差多少,反正虱子多了不咬。所以,营收环比仅仅下滑1.9%,几乎没太大变化。毛利率26%,比Q3略微增长,比去年同期的16%甚至大幅度改善。这也是连续第二个季度毛利率维持在25%以上。CEO表示这是PacBio通过内部化更多仪器制造流程,显著降低了Revio和Vega系统的单位成本。Revio系统的制造成本在2024年下降了16%,耗材的单位成本下降了22%。公司仪器设备销售收入1530万美元,同比下滑56%,但是...今年就没好过...看环比下滑9%左右,就这德性吧..管理层归咎于全球宏观经济环境的不确定性导致客户购买决策延迟,尤其是对高资本支出的Revio测序系统的采购。而新产品(如Vega和SPRQ化学试剂)的市场推广和客户接受需要时间,短期内难以完全弥补收入缺口。旗舰产品Revio出货23台,约为去年同期一半。新产品Vega刚刚推出,只卖了7台。好在,试剂收入1880万美元左右,同比持平,环比微增2%左右。至少表示PacBio的设备使用还算正常,不是都扔在那里闲置。全年PacBio录得营收1.54亿美元,相较于去年的2.01亿美元下滑约23%。对比PacBio给自己定下的KPI(财务指引)好像是完成了...人家毕竟说的是<1.7亿美元。你就说1.54亿美元算不算小于1.7亿美
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      ·02-15

      诺辉健康:朱叶青时代终结

      环球视野,深度视角各位亲爱的股东,大家早上好中午好晚上好。朱叶青走了,离开了诺辉健康,以一种不是很体面的方式。2025年2月12日,诺辉健康发布公告,宣布“罢免朱叶青先声本公司执行董事一职”提案以约80%:20%的票数获得通过。至此,朱叶青与诺辉健康只有手中的股票这一链接了。一个公司创始人、前CEO、前董事长,竟然以被罢免这种形式离开,实在是不够体面。然而,体面直值几个钱?在2025年1月21日的公告中,写的很清楚:“...财务状况持续下滑,所有董事会成员(除朱叶青先生外)均认为本公司应当严格控制各方面支出...因此启动人员优化、经营优化、费用控制等措施实属必要。然而,朱叶青先声采取了与董事会其他成员截然不同的方法”当然,理由并不重要,重要的是朱叶青已经走到了所有人的对立面。这一切,早在2024年12月31日的公告中注定了。随着前非执行董事姚纳接棒董事会主席,也许,一个新的诺辉时代要开始了。当然,也许,意味着其他的终结。姚纳新,浙江慈溪人,北京大学生物工程专业毕业。后赴美国攻读伯克利大学分校生物工程硕士,又在斯坦福大学商学院获得了管理学硕士学位。实际上,姚纳新是诺辉健康的天使投资人。而且,姚纳新和陈一友、朱叶青和吕宁是北京大学88级生物系的同学。金樽共汝饮,白刃不相饶有趣的是,本次股东特别大会是在姚纳新的聚光中心举行的。这背后代表的是什么意思,就不宜过多解读了。另外,诺辉今年有望复牌吗?调查结果如何了?朱叶青时代终结,是不是意味着这一切又有了希望?反正,离开会议室的人也没办法在会议室发言了。END
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      诺辉健康:朱叶青时代终结
     
     
     
     

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